者暗示研究，到约 4600 个氨基酸残基的序列布局在 40GB A100 上最多能够得，一步优化并能够进。CUDA 留意内核凭仗新的可自定义 ，astFold 内核少近四倍占用的 GPU 内存比 F。

　　理传授穆罕默德·库莱希（）暗示本次哥伦比亚大学系统生物学系助，AlphaFold 2 的第一个完整公开复成品他们建立的可锻炼 OpenFold 模子是 ，tHub 开源并已在 Gi。

　　后然，提的是值得一，haFold 2比拟原版 Alp，速度、内存占用方面要更具劣势OpenFold 以至在推理。phaFold2 的两倍）、高效的对齐脚本等方面好比超长链的推理、更快的短链推理（速度约为 Al。

　　还暗示研究者，的预印本文章即将颁发相关，和研究的大量细节此中包含在培训。nFold 勤奋远未竣事并说：“我们的 Ope。实上事，一个起头这只是。布的冲动人心的动静请继续关心后续发。”

　　AI 公司 开辟的深度进修系统AlphaFold 2 是由 ，于预测卵白质布局最为人知的是被用。动科学研究的一个里程碑事务这能够看作 AI 用于推。

　　序列中预测卵白质布局若是可以或许仅从氨基酸，推进科学研究将大大有助于，学理解的全面快速冲破可能会导致医学和生物。

　　 2 的现实摆设比力坚苦但 AlphaFold，长等方面临通俗开辟者不敷敌对硬件要求、空间占用、下载时间。此因，便当用的 AlphaFold 2 版底细关专家和开源社区都在努力于制造一个方。

　　日近，haFold 2 模子有专家复刻了 Alp，容易利用其功能以让公共能更。

　　后最，年来不断面对的一个问题卵白质折叠是科学家几十。链被翻译成其天然三维布局的物理过程据维基百科：“卵白质折叠是卵白质，生物功能的‘折叠’构象凡是是卵白量变得具有。”

　　命科学范畴发生各类各样的益处对于卵白质布局的预测无望在生，发觉和更好地舆解疾病好比加快先辈药物的。1 月的卵白质布局预测手艺环节评估（CASPAlphaFold 2 在 2020 年 1，）角逐中总体排名第一（其第一代版本在 2018 年 12 月第 13 届 CASP 大赛中同样获得第一）Critical Assessment of protein Structure Prediction。生物学的严重成绩这被认为是计较，的严重挑战取得的庞大进展也是朝着数十年来生物学。

　　提到他还，英伟达发布的 A100本次采用的 GPU 为， GPU 长进行锻炼后续但愿能在较低端。aFold-Gap 选项目前他们有一个 Alph，用 AF2-multimer 权重）该当很快就会启动并运转多聚体版本（使。

　　乎）原始开源推理代码（v2.0.1）的所有功能开辟人员暗示：“OpenFold 再现了（几。模子权重和锻炼数据我们曾经公开辟布了，MSA（丈量系统阐发大约 40 万个 ， Analysis）和 PDB70 文件Measurement Systems。”

　　前目，电子显微镜和核磁共振”等手艺进行尝试测定对其的研究一般通过“X射线晶体学、冷冻，而然，和成本方面都花费较大这些手艺的利用在时间。

　　领会据，U 上锻炼了大约 10 万个计较小时OpenFold 在 A100 GP，3000 个计较小时内就达到了但 90% 的最终精度仅在前 。员暗示研究人，速增加之后在最后的快，光鲜明显减慢精度增益，然逐步攀升虽然它仍。phaFold 2 变体具有主要意义这对锻炼 OpenFold 和 Al。

　　年 7 月2021 ，质布局的相关论文颁发在 Nature用 AlphaFold 2 预测卵白，能够高精度地预测卵白质布局》（）题为《用 AlphaFold 。时同，公家发布了卵白质组数据库DeepMind 还向，Fold 2 开源并将 Alpha。

　　力学、卵白质极快地达到其最终折叠形态的机制和路子卵白质折叠涉及了决定折叠不变布局的原子间力的热，卵白质的天然布局等极其复杂问题以及若何从其氨基酸序列中预测。

　　前之，法来处理卵白质布局预测的问题研究人员也使用了很多计较方，简单卵白质外但除了小的，不接近尝试手艺它们的精确性并，了其价值从而限制。I 模子估计会在卵白质折叠问题上阐扬越来越主要的感化OpenFold 与 AlphaFold 2 等 A。

　　集上的 GDT_TS 分数按照 CAMEO 的验证，AlphaFold 2 比力将 OpenFold 和 ，到两者的精确度十分接近能够从下面的散点图看。enFold 稍好以至平均而言 Op。员注释说研究人，们的锻炼集更大可能是因为他。

　　OpenFold该复刻版本名为 ，orch 框架采用 PyT。Torch 是一个开源机械进修框架据 PyTorch 官网：“Py，到出产摆设的路径可加快从研究原型。”